MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 296788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017186	CCA	2	6	18212	18217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_017186	CTCG	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017186	CAG	2	6	18280	18285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145150
504	NC_017186	CGG	2	6	18301	18306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145150
505	NC_017186	GGCC	2	8	18308	18315	0 %	0 %	50 %	50 %	384145150
506	NC_017186	TCG	2	6	18324	18329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145150
507	NC_017186	CGT	2	6	18385	18390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145150
508	NC_017186	TCG	2	6	18399	18404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145150
509	NC_017186	TCA	2	6	18408	18413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145150
510	NC_017186	CTC	2	6	18416	18421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145150
511	NC_017186	CGGC	2	8	18492	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_017186	GC	3	6	18498	18503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017186	G	6	6	18509	18514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017186	CCGG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017186	GCG	2	6	18563	18568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145151
516	NC_017186	GTC	2	6	18597	18602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145151
517	NC_017186	GCC	2	6	18632	18637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145151
518	NC_017186	GTG	3	9	18638	18646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145151
519	NC_017186	CGGG	2	8	18709	18716	0 %	0 %	75 %	25 %	384145151
520	NC_017186	CAG	2	6	18721	18726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145151
521	NC_017186	GACG	2	8	18736	18743	25 %	0 %	50 %	25 %	384145151
522	NC_017186	GGA	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145151
523	NC_017186	TGCGG	2	10	18890	18899	0 %	20 %	60 %	20 %	384145151
524	NC_017186	AGA	2	6	18900	18905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145151
525	NC_017186	GAGC	2	8	18928	18935	25 %	0 %	50 %	25 %	384145151
526	NC_017186	CGG	2	6	19098	19103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145151
527	NC_017186	CACG	2	8	19123	19130	25 %	0 %	25 %	50 %	384145151
528	NC_017186	GCG	2	6	19180	19185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145151
529	NC_017186	CG	3	6	19184	19189	0 %	0 %	50 %	50 %	384145151
530	NC_017186	GTG	2	6	19220	19225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145151
531	NC_017186	GCC	2	6	19289	19294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145151
532	NC_017186	CGGCG	2	10	19425	19434	0 %	0 %	60 %	40 %	384145152
533	NC_017186	GGC	2	6	19464	19469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145152
534	NC_017186	CGT	2	6	19500	19505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145152
535	NC_017186	CAG	2	6	19519	19524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145152
536	NC_017186	GCG	2	6	19568	19573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145152
537	NC_017186	CCG	2	6	19613	19618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145153
538	NC_017186	GCA	3	9	19738	19746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145153
539	NC_017186	CGT	2	6	19864	19869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145153
540	NC_017186	CTCG	2	8	19890	19897	0 %	25 %	25 %	50 %	384145154
541	NC_017186	GCG	2	6	19916	19921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145154
542	NC_017186	CTT	2	6	19960	19965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145154
543	NC_017186	GATC	2	8	19986	19993	25 %	25 %	25 %	25 %	384145154
544	NC_017186	ACC	2	6	20008	20013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145154
545	NC_017186	GCC	2	6	20029	20034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145154
546	NC_017186	CGTC	2	8	20218	20225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_017186	CGT	2	6	20296	20301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017186	TAGT	2	8	20312	20319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017186	CCG	2	6	20409	20414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
550	NC_017186	GC	3	6	20546	20551	0 %	0 %	50 %	50 %	384145155
551	NC_017186	GCC	2	6	20670	20675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
552	NC_017186	GCT	2	6	20694	20699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145155
553	NC_017186	CTG	2	6	20776	20781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145155
554	NC_017186	CCAC	2	8	20834	20841	25 %	0 %	0 %	75 %	384145155
555	NC_017186	CGC	2	6	20892	20897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
556	NC_017186	GCAGC	2	10	20914	20923	20 %	0 %	40 %	40 %	384145155
557	NC_017186	CA	3	6	20967	20972	50 %	0 %	0 %	50 %	384145155
558	NC_017186	GC	3	6	20990	20995	0 %	0 %	50 %	50 %	384145155
559	NC_017186	GC	3	6	21021	21026	0 %	0 %	50 %	50 %	384145155
560	NC_017186	CCGA	2	8	21040	21047	25 %	0 %	25 %	50 %	384145155
561	NC_017186	ACG	2	6	21053	21058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145155
562	NC_017186	GC	3	6	21065	21070	0 %	0 %	50 %	50 %	384145155
563	NC_017186	GCG	2	6	21107	21112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145155
564	NC_017186	CGA	2	6	21129	21134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145155
565	NC_017186	GCC	2	6	21136	21141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
566	NC_017186	CTG	2	6	21181	21186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145155
567	NC_017186	CAGCC	2	10	21189	21198	20 %	0 %	20 %	60 %	384145155
568	NC_017186	CGT	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145155
569	NC_017186	GCC	2	6	21253	21258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
570	NC_017186	CGC	2	6	21264	21269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
571	NC_017186	GAC	2	6	21309	21314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145155
572	NC_017186	CG	3	6	21334	21339	0 %	0 %	50 %	50 %	384145155
573	NC_017186	CCG	2	6	21351	21356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145155
574	NC_017186	GA	3	6	21437	21442	50 %	0 %	50 %	0 %	384145155
575	NC_017186	CGA	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017186	TAG	2	6	21669	21674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017186	GAA	2	6	21762	21767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017186	CGT	2	6	21793	21798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017186	C	7	7	21801	21807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
580	NC_017186	GAGT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017186	AG	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017186	ATC	2	6	21937	21942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145156
583	NC_017186	ATT	2	6	21956	21961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145156
584	NC_017186	GCT	2	6	21978	21983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145156
585	NC_017186	ATCCC	2	10	22001	22010	20 %	20 %	0 %	60 %	384145156
586	NC_017186	TTG	2	6	22094	22099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145156
587	NC_017186	CGA	2	6	22117	22122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145156
588	NC_017186	CG	3	6	22136	22141	0 %	0 %	50 %	50 %	384145156
589	NC_017186	GTC	2	6	22154	22159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145156
590	NC_017186	GTAG	2	8	22200	22207	25 %	25 %	50 %	0 %	384145156
591	NC_017186	TGT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145156
592	NC_017186	AGT	2	6	22246	22251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145156
593	NC_017186	GCTC	2	8	22294	22301	0 %	25 %	25 %	50 %	384145156
594	NC_017186	CAGC	2	8	22315	22322	25 %	0 %	25 %	50 %	384145156
595	NC_017186	CG	3	6	22341	22346	0 %	0 %	50 %	50 %	384145156
596	NC_017186	GCTC	2	8	22405	22412	0 %	25 %	25 %	50 %	384145156
597	NC_017186	CAGC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	25 %	50 %	384145156
598	NC_017186	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	384145156
599	NC_017186	TGG	2	6	22477	22482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145156
600	NC_017186	GCTC	2	8	22510	22517	0 %	25 %	25 %	50 %	384145156
601	NC_017186	CCA	2	6	22524	22529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145156
602	NC_017186	TAGC	2	8	22531	22538	25 %	25 %	25 %	25 %	384145156
603	NC_017186	CT	3	6	22604	22609	0 %	50 %	0 %	50 %	384145156
604	NC_017186	CAGC	2	8	22624	22631	25 %	0 %	25 %	50 %	384145156
605	NC_017186	CT	3	6	22715	22720	0 %	50 %	0 %	50 %	384145156
606	NC_017186	CAGC	2	8	22735	22742	25 %	0 %	25 %	50 %	384145156
607	NC_017186	CT	3	6	22826	22831	0 %	50 %	0 %	50 %	384145156
608	NC_017186	GGC	2	6	22916	22921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
609	NC_017186	GCG	2	6	22953	22958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
610	NC_017186	TGCC	2	8	22960	22967	0 %	25 %	25 %	50 %	384145156
611	NC_017186	CAG	2	6	23023	23028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145156
612	NC_017186	CGGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	50 %	50 %	384145156
613	NC_017186	GCG	2	6	23064	23069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
614	NC_017186	TGA	2	6	23152	23157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145156
615	NC_017186	GTC	2	6	23189	23194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145156
616	NC_017186	CAA	2	6	23281	23286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145156
617	NC_017186	CGT	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145156
618	NC_017186	TTC	2	6	23345	23350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145156
619	NC_017186	GTA	2	6	23432	23437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145156
620	NC_017186	CTC	2	6	23438	23443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145156
621	NC_017186	CAA	2	6	23570	23575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145156
622	NC_017186	GGC	2	6	23651	23656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
623	NC_017186	CAGC	2	8	23699	23706	25 %	0 %	25 %	50 %	384145156
624	NC_017186	ATCCGC	2	12	23732	23743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384145156
625	NC_017186	CAG	3	9	23858	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145156
626	NC_017186	CGG	2	6	23923	23928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
627	NC_017186	GAT	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145156
628	NC_017186	GTC	2	6	24029	24034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145156
629	NC_017186	AGC	2	6	24080	24085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145156
630	NC_017186	CAC	2	6	24110	24115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145156
631	NC_017186	TG	3	6	24136	24141	0 %	50 %	50 %	0 %	384145156
632	NC_017186	CAC	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145156
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634	NC_017186	CGG	2	6	24177	24182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
635	NC_017186	CCG	2	6	24187	24192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145156
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642	NC_017186	GCA	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145156
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649	NC_017186	CGG	2	6	24775	24780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
650	NC_017186	ATCA	2	8	24800	24807	50 %	25 %	0 %	25 %	384145156
651	NC_017186	ATC	2	6	24830	24835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145156
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654	NC_017186	GGC	2	6	24981	24986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145156
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660	NC_017186	CG	3	6	25517	25522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
661	NC_017186	GATC	2	8	25589	25596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
662	NC_017186	TCT	2	6	25619	25624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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714	NC_017186	GCCGTG	2	12	28183	28194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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730	NC_017186	CAC	2	6	28811	28816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145161
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732	NC_017186	ACG	2	6	28858	28863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145161
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751	NC_017186	GGCC	2	8	29405	29412	0 %	0 %	50 %	50 %	384145161
752	NC_017186	CGA	3	9	29414	29422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145161
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754	NC_017186	CGA	2	6	29489	29494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145161
755	NC_017186	CGA	2	6	29540	29545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145161
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757	NC_017186	TGC	2	6	29769	29774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145162
758	NC_017186	CCG	2	6	29808	29813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145162
759	NC_017186	CAT	2	6	29836	29841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145162
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761	NC_017186	CGT	2	6	29893	29898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145162
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784	NC_017186	ACC	2	6	30661	30666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145163
785	NC_017186	CG	3	6	30678	30683	0 %	0 %	50 %	50 %	384145163
786	NC_017186	CGT	2	6	30689	30694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145163
787	NC_017186	CGT	2	6	30705	30710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145163
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789	NC_017186	GC	3	6	30756	30761	0 %	0 %	50 %	50 %	384145163
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792	NC_017186	CGG	2	6	30818	30823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145163
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801	NC_017186	CCG	2	6	31070	31075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145163
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821	NC_017186	CGCC	2	8	31673	31680	0 %	0 %	25 %	75 %	384145163
822	NC_017186	TCG	2	6	31741	31746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145163
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839	NC_017186	CGG	2	6	32284	32289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145163
840	NC_017186	CGC	3	9	32316	32324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145163
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864	NC_017186	CGG	2	6	33260	33265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145163
865	NC_017186	CGA	2	6	33290	33295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145163
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867	NC_017186	GCG	2	6	33451	33456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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869	NC_017186	CAC	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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875	NC_017186	CCG	2	6	33826	33831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145164
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879	NC_017186	ACC	2	6	33932	33937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145164
880	NC_017186	CCG	2	6	33952	33957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145164
881	NC_017186	GCT	2	6	34011	34016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145164
882	NC_017186	AGC	2	6	34079	34084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145164
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